Hum... En antecedentes:
El Emperador es el ser casi divino que unifica a la raza humana en Terra y pone fin a la era oscura de la humanidad. Crea un ejercito de tíos tan sobradamente sobrehumanos que se podrían considerar semidioses (Los Primarcas) pero durante la creación de estos van los Dioses Oscuros del Caos y los mandan a freír monas a lo ancho y largo de la galaxia.
El emperador los va recogiendo y se unen a unos ejércitos de humanos modificados genéticamente usando los ADN de los primarcas para hacerlos unos guerreros extraordinarios. Así todos juntitos se embarcan en "La Gran Cruzada" para "recuperar" la galaxia para la humanidad.
Ocurre que en un momento dado El Emperador decide que pasa ya de seguir guerreando entre las estrellas y que se vuelve a su palacio en Terra a mantener el control del Imperio. Al mando del ejército deja a Horus, su hijo más querido, como Señor de la Guerra.
Lo que pasa que algunas legiones de marines de tanto viajar y ver cosas nuevas estaban corrompidas por el Caos aunque no se les notara, y aprovechando que muchos veían la marcha del Emperador como una traición los corrompieron también, incluyendo a Horus, para digamos, pasarse al lado oscuro.
La llamada Herejía de Horus es básicamente la mitad de los ejércitos de Marines Espaciales contra la otra mitad, llevando la batalla hasta Terra.
En Terra, en una lucha épica entre El Emperador (prácticamente un dios) y Horus (menos poderoso per se que su padre, pero ayudado por el poder oscuro del caos), acaba con la muerte de Horus a manos de su padre, y con El Emperador tan gravemente herido que debe quedarse en El Trono Dorado, una máquina que le mantiene con vida, para toda la eternidad. (Al módico precio de cargarse unos 1000 astrópatas (psíquicos humanos) al día oiga).
Desde aquella, cancelada la Gran Cruzada, los marines se dedican más a defender lo que ya hay de los ataques de razas alienígenas, como los Tiránidos.